综合管理部：负责研究院日常行政管理工作，重要会议及活动组织安排；负责起草、印发研究院文件及公文流转；负责对外宣传、信息报送、接待和内外协调工作；负责研究院财务管理工作；负责研究院国有资产管理和综合保障工作；完成院领导交办的其他任务。

人力资源部：负责组织人才引进及人员招聘工作；负责人事合同管理工作；负责拟定实施研究院薪酬制度、绩效考核工作；负责拟定员工培训计划，并组织实施各类培训活动；完成院领导交办的其他任务。

科研发展部：负责研究院科研发展规划研究；负责研究院筹建期设备采购运行；负责科研活动实施与监督、科研成果管理、科研成果转化、知识产权保护；负责科研项目申报、立项、过程管理及结题验收、成果报奖等全过程管理；负责国内外科研合作有关事项；完成院领导交办的其他任务。

国际合作交流部：负责研究院外事活动组织协调；负责与牛津大学的联络工作；负责外籍专家服务保障工作；完成院领导交办的其他任务。

基建保障部：负责基建工程的规划、设计、勘察、施工、监理等工程管理工作；负责基建工程招投标、合同、预决算等经济管理工作；负责基建档案管理工作；负责工程验收、移交和质保期限内的相关工作；负责能源管理、楼体管理、实验室安全、消防安保等管理工作；完成院领导交办的其他任务。